藿香正氣丸和藿香正氣水在主要功效和成分上基本一致，但存在一些明顯的區別，包括劑型不同、服用方法不同、吸收與藥效發揮速度、成分與刺激性、禁忌與注意事項等。
1.劑型不同：藿香正氣丸是一種丸劑，屬于顆粒藥。藿香正氣水是一種液體制劑，屬于水劑藥。
2.服用方法不同：藿香正氣丸需要用溫開水吞服。藿香正氣水則需要用溫開水直接送服。
3.吸收與藥效發揮速度：藿香正氣水機體吸收力高，藥物在體內發揮作用迅速。藿香正氣丸的藥效發揮速度相對較慢，但持續時間可能更為持久。
4.成分與刺激性：兩者主要成分包括蒼術、陳皮、厚樸、白芷、茯苓、甘草、紫蘇葉等。藿香正氣水中含有大量的酒精，刺激性比較強，容易對胃腸道造成刺激，可能引起惡心、嘔吐、腹瀉等不適癥狀。
5.禁忌與注意事項：對藿香正氣丸成分過敏者禁用，以免引起過敏反應。藿香正氣水不建議對酒精過敏者和嚴重肝腎功能不全者使用，以免加重病情。
此外，二者在治療范圍方面也有區別，因此，在使用這兩種藥物時，應根據個人的具體情況和醫生的建議進行選擇和使用。