為預防扁桃體炎的發生，建議孩子的營養攝入要全面，不能太挑食，這樣體內才會呈現一種動態平衡的健康狀態；同時注意口腔衛生，每天早晚刷牙、飯后清水漱口、避免食物殘渣留存在口腔中。在呼吸道傳染病高發的季節中，空調房間與室外溫差不可太大，居室要保持空氣新鮮流通，相對濕度可在45%至55%間；體弱的孩子也可采取預防接種，通過預防呼吸道感染來預防扁桃體發炎。