腸道外感染的許多疾病，腹瀉是很不顯著的癥狀，不容易引起誤診，但急性闌尾炎及原發性腹膜炎則很容易引起誤診，故分述如下：

急性闌尾炎

急性闌尾炎與感染性腹瀉的相同點是急性發病，發熱、腹痛、腹瀉、惡心、嘔吐;不同點是闌尾炎時發熱一般低熱或中等發熱，而感染性腹瀉，則可無熱到高熱，各種發熱均可能，闌尾炎時腹痛、呈轉移性，由上限轉向右下腹痛，而感染性腹瀉時腹痛常在下腹、臍周、甚至左下腹;闌尾炎時腹瀉常常不重，3-5次稀便，但感染性腹瀉時腹瀉多數是很明顯的.經常是10次左右。體格檢查時，闌尾炎有右下腹固定的、并且是局限的壓痛，局部還可能有肌緊張及反跳痛，而感染性腹瀉時腹壓痛常在下腹、臍周，左下腹痛，有時也有右下腹壓痛，但常不太固定，而且范圍不局限，常常下腹，甚至左下腹同時有壓痛，常常無局部的腹膜刺激癥狀。

原發性腹膜炎

常見于肝硬變基礎上，相同點為發熱、腹痛、腹瀉、惡心、嘔吐，不同點是常有肝硬變的體征(因為是代償期常無肝硬變的癥狀)如肝掌、蜘蛛痣、肝面容等，其次有腹膜炎的表現，如全腹壓痛、反跳痛;最突出的是可能查出移動性濁音或超聲波檢查可查出液性平段。可幫助確診(由于有一定量腹水，可使腹膜刺激癥變得不明顯)。所以凡疑及感染性腹瀉，而能檢查到肝硬變表現時，應仔細檢查移動濁音，如能證明腹水，則作試驗穿刺，腹水如果是微混濁的，化驗證明是滲出液時，病人的腹瀉應考慮系原發性腹膜炎所致。

宮外孕

在非感染性腹瀉中，多數是慢性疾病，仔細問病史，仔細檢查，診斷不難，不易與急性感染性腹瀉混淆，但宮外孕是例外。宮外孕時，可有腹痛、腹瀉、惡心、嘔吐，而且突然發生。這些與感染性腹瀉相同。宮外孕時常有低血壓，容易誤診為中毒性痢疾。但這個低血壓恰恰是讓人引起懷疑的線索，因為從感染性腹瀉來考慮，病人的休克不好解釋;既沒有明顯的感染中毒癥狀，也沒有大量丟失體液的癥狀及脫水的癥狀，如果病人是育齡婦女，則應考慮宮外孕之可能。尿的妊娠試驗，腹有移動濁音而且超聲波檢查證實有液平段，腹試穿抽出血性腹水，診斷即可確立。