治療前列腺炎的藥物有很多種，根據不同的前列腺炎癥狀，選擇不同的治療藥物。消炎藥是治療前列腺炎的必備藥物之一，但無菌性前列腺炎的治療吃消炎藥是沒有用的。

抗菌藥物對無菌性前列腺炎患者療效并不大，這是無菌性前列腺炎患者不管服用多少抗菌藥物而病情總是反復發作的重要原因。要想徹底祛除無菌性前列腺炎困擾，必須查清病因，進行綜合治療，做好日常調理防護。

許多青壯年男子在不少醫院看過病，抗菌的中、西藥物均服用過，但病情卻遷延不愈的患者并不少見。這是因為慢性前列腺炎并非都是因細菌入侵引起的，有相當一部分患者的病灶中并沒有致病菌，因此，抗菌藥物當然就沒有用武之地了。臨床醫生將癥狀像慢性前列腺炎、前列腺液中有白細胞增多，但涂片及培養都沒有細菌，尿液檢查也沒有細菌的這類病例命名為無菌性前列腺炎。不過，由于慢性前列腺炎的致病原因還有滴蟲、霉菌、衣原體、支原體等多種病原微生物，以及過敏等特殊因素，因此，通常也將以上原因和因素除外后才認為是無菌性前列腺炎。