先天性崎形的陰莖通常指陰莖在胚胎發育中形成的畸形，一殷說來是十分罕見的。
　　
Ａ.陰莖缺如：陰莖發育障礙而缺如，但陰囊、睪丸發育正常，由于陰莖缺如，尿道常開口于會陰部、肛門或直腸內，因此排尿方向方向發生改變，當然就更不能進行性交活動。
　　
Ｂ.潛伏陰莖：陰莖被陰囊、會陰部、恥骨部及大腿內側皮下脂肪組織掩蓋，而陰莖又短小，很易誤診為陰莖缺如癥，但隨著發育，皮下脂肪減少，陰莖可顯露。潛伏陰莖多數合并泌尿系統畸形，需進行手術治療。
　　
Ｃ.陰囊后陰莖：陰莖位于陰囊后側（肛門側），多數合并泌尿系統畸形，需作手術治療。
　　
Ｄ.雙陰莖：顧名思義是具有二只陰莖，雙陰莖可有左右排列的，也有前后方向排列的，雙陰莖有陰莖完整分成兩個的，也有從陰莖根部分成兩個的，也有從龜頭分成兩個的。雙陰莖多數合并泌尿系統畸形，需作矯形手術。
　　
Ｅ.先天性陰莖扭轉癥：陰莖在縱軸90～180度旋轉或左右旋轉，通常向左旋轉占80％，向右旋轉占20％，陰莖扭轉易合并陰莖異常勃起，勃起不適或隱痛等癥狀。
　　
Ｆ.先天性陰莖彎曲癥：多數合并泌尿系統畸形，若不影響性交和排尿一般不作治療，否則需作手術治療