一、染色異常:若畸形精子超過70%，則患者很可能存在染色體病，這時應進行染色體檢查，染色體病治療難度較大。

二、炎癥引起精子畸形：多見于泌尿生殖道感染、先天性睪丸發育不全、腮腺炎并發的睪丸炎、附睪結核、慢性中毒、營養不良、精神過度緊張、性交過頻、精索靜脈曲張等均是導致畸形精子癥的病因。

三、生殖器官病變：如：睪丸、附睪、精囊腺受到放射線照射，可引起精子發生突變，這種導致畸形精子癥的病因與精細胞突變與照射強度、照射時間有關。

四、高溫、酗酒是導致精子畸形的原因：陰囊局部長期高熱、長期酗酒，均是畸形精子癥的病因。酗酒和長期飲用酒精含量較高的烈性酒，可以損害睪丸生精細胞功能、干擾精子生長成熟，使精子畸形。

五、激素或某些化學藥物導致精子畸形：如：地糖皮質激素類長期服用、抗癌藥、利血平、馬利蘭、呋喃類等對精原細胞的分裂和精子成熟亦有干擾作用，也會導致精子畸形。尤其值得注意的是，相對不是很嚴重的精子畸形有時也會使妻子懷孕，但是，這種懷孕是容易出現胚胎停止發育、流產、早產的，當然不利于優生優育。

男性精子畸形是一種多發性的常見病，精子質量低下也是威脅男性不育的一大問題。為了家庭的幸福完整，男性要切實保護好自身精子。