附睪實質是一組管道系統，附睪頭系由15-20條睪丸輸出小管構成50-10個附睪圓錐，最后僅匯合成一條附睪管，高度盤曲成附睪體和尾，然后移行成輸精管。附睪的作用主要為精子成熟提供運行和存放環境，精子由睪丸產生后，并不具備與卵子結合的能力，附睪這時候起到了重要作用，精子在附睪后達到成熟，獲得運動能力，獲得識別卵子透明帶能力，獲得和卵子結合的能力。

此外附睪也擔負了儲存成熟精子的作用。可以說附睪是精子重要生活環境，附睪出現炎癥能直接誘發男性不育。根據動物實驗的結果，附睪的功能不僅僅是一根單純的精子通道，因為取自附睪頭部的精子受精能力大大低于取自附睪尾部的精子。

附睪不同部位的功能不同，附睪頭部有重吸收睪網液和進行電解質成分交換功能，附睪體有分泌附睪液和多種生化物質功能，附睪尾則有成熟精子和貯存、排放精子等功能。此外，附睪液與血液間的分子交換也有一定限制，這種精子內環境與血液的隔離作用也稱為血附睪屏障。目前認為精子在附睪內發生了降低代謝率和耗氧量并儲備能量等變化，使精子進一步成熟貯存于附睪尾，在性高潮時強烈收縮驅排精子參與射精活動。