有典型臨床表現者，根據病史結合必要的實驗室檢查，診斷一般不難。本病應與下列疾病進行鑒別：
（1）硬下疳：常為單個境界清楚的圓形潰瘍，直徑1cm～2cm，質硬、周邊稍微隆起，無疼痛和觸 痛，伴有無痛性單側腹股溝淋巴結腫大；暗視野顯微鏡檢查可查到梅毒螺旋體；梅毒血清反應可呈陽性。若出現潰瘍大、有觸痛，延遲愈合，伴雙側腹股溝淋巴結不痛性腫大時應考慮兩病合并的可能。
（2）軟下疳：潰瘍較深、邊緣不整齊、分泌物多，疼痛和觸痛更明顯，常有化膿}生腹股溝淋巴結腫大；直接涂片可查到短鏈狀G-桿菌；培養可查到杜克雷嗜血桿菌。
（3）接觸性皮炎：生殖器部位接觸性皮炎可引起水皰、糜爛和結痂，有接觸過敏史，炎癥超過水皰及糜爛的范圍；查不到HSV.
（4）固定型藥疹：生殖器部位固定型藥疹也可引起水皰、糜爛及結痂，有藥物過敏史，水皰不成簇，病損消退后有明顯的色素沉著；查不到HSV.
（5）白塞病：常有口腔和生殖器潰瘍、皮膚結節性紅斑、毛囊炎損害及眼部病變，生殖器潰瘍大而深，持續時間長；HSV檢查陰性；皮膚病理提示血管性病變。
此外還應與生殖器部位帶狀皰疹、膿皮病、Crohn病和念珠菌病等進行鑒別。
