原發性生殖器皰疹的潛伏期較短，一般為2至7天，平均5天。
男性容易多發部位：于龜頭、陰莖、尿道口、陰囊和大腿、臂部等處，女性容易多發于陰唇、子宮頸、外陰等處，陰道粘膜受累較少。
皮損形態及演變：GH感染的潛伏期后，上述部位即有燒灼感或刺痛，隨即出現紅斑伴群集瘙癢的小紅丘疹，并迅速變成小水皰，多個成群水皰可變為膿皰。3~5天后小皰破潰，形成糜爛或潰瘍，而后結痂痊愈，病程約15~25天。患者自覺瘙癢、灼熱和輕度腫脹，潰瘍處疼痛明顯。
全身癥狀及并發癥：發病前夕或發病時可有全身癥狀，例如發熱、頭痛、不適、頸項強直感、S2 ~ S4 段感覺異常，或有排尿困難和白帶增多，幾乎所有原發性GH均可伴有淋巴結腫大、壓痛，往往1~2個月后才緩慢消退。男性常并發淋巴管、淋巴結炎和精囊炎，女性可并發宮頸炎、子宮內膜炎。嚴重者可合并腦膜炎、尿道炎、急性尿潴留和宮頸癌。
