乙肝病毒通過生育由媽媽傳染孩子的過程，就是醫生常說的乙肝母嬰傳播或者垂直傳播。大多數的乙肝病毒母嬰傳播是在分娩過程中發生的。這與分娩時新生兒接觸乙肝病毒陽性媽媽的血液和體液有關。

單用乙肝疫苗阻斷母嬰傳播的成功率只有87.8%。因此對乙肝表面抗原陽性媽媽的新生兒，應在出生后24 小時內盡早(最好在出生后12內)注射乙肝免疫球蛋白(劑量應≥ 100 IU)，同時在不同部位接種10 μg乙肝疫苗。然后在1個月和6個月時分別接種第2和第3針乙肝疫苗，這樣處理可以使成功率上升至95%以上。

乙肝病毒定量(HBV DNA)水平是影響乙肝母嬰傳播的最關鍵因素。 HBV DNA水平較高(> 2×106IU/ml)的媽媽更易發生母嬰傳播。近年有研究顯示，對這部分媽媽除了應用上述乙肝疫苗聯合乙肝免疫球蛋白預防措施外，還可以在妊娠中后期(從孕24-28周開始)應用抗病毒藥物。這樣可使孕婦產前血清中HBV DNA水平降低，提高新生兒的母嬰阻斷成功率。在現有的口服抗乙肝病毒藥物中，替諾福韋酯、替比夫定和拉米夫定對胎兒發育較為安全，是推薦使用的母嬰阻斷藥物。因為用藥的目的是提高母嬰傳播阻斷成功率，而不是媽媽本身需要抗病毒治療;所以，這種情況下媽媽是可以停藥的。為了減少停藥后的肝功異常，建議于產后1～3個月停藥。

現在已經有很多研究證實，乙肝病毒不會通過母乳喂養傳染新生兒。因此，孩子在出生12 小時內注射過乙肝免疫球蛋白和乙肝疫苗后，就可以接受乙肝表面抗原陽性媽媽的哺乳了。但是，由于目前還不清楚抗病毒藥物是否會通過乳汁影響嬰兒的生長發育，對于媽媽服用抗病毒藥物進行母嬰傳播阻斷的情況下，只有在媽媽停藥后才可以母乳喂養。