性變態的病因尚不明確，它們包括生物遺傳方面、心理學方面、環境和社會等方面因素的影響。他們只是在歪曲的性沖動支配下，在特定的情景和處境下突然付諸行動，當時怎幺也控制不了自己，他們在事前并無周密準備，案發后又能供認不諱，常常感到痛心疾首，無限悔恨，有些人強烈要求醫治，希望擺脫這種令人痛苦的狀況，但也有些人則不認為自己是病態。

目前，在診斷性變態問題上尚缺乏明確、客觀的指標，這種指標也往往帶有明顯的社會文化烙印，并隨著歷史的變遷而變化。下面將具有分析一下性變態的各種可能的原因：

多年來生物遺傳方面研究的結果表明，大腦和神經系統中并未能證實有任何特別的化學物質與性變態有關，而激素方面的研究結果始終是矛盾的，無法作出任何結論。專家們正致力尋找遺傳基因方面的問題。

性心理障礙的患者中常常存在不同程度的人格缺陷。如強迫性人格--刻板固執，又稱執拗性人格。辦事循規蹈距，墨守陳規，意識保守，缺乏隨機應變能力，遇事猶柔寡斷不善決斷，對自己要求高但缺乏自信，工作負責過于謹慎。這些人容易產生強迫性癥狀和焦慮、抑郁反應。此外，有些人可能具有分裂型(如窺淫癥)、未成熟型或被動型人格(如露陰癥)。

幼年和早年性心理發展中的挫折或沖突與成年后的性變態有著心理動力學上的因果關系。男孩由于愛母親而把父親當作情敵而嫉恨，又怕父親生氣會割去他的陰莖而心懷恐懼，當其年齡再大些，男孩將放棄對母親的愛戀而仿同其父，這樣男孩的俄狄浦斯愛戀便得到正常解決。否則，這種愛戀就會凝固并在無意識中形成俄狄浦斯情結，對以后的性格形成嚴重的不良影響，成為日后性心理變態的根源。

一般來說，反常的變態的性行為是不合理的社會強制和壓抑所造成的性心理沖突的后果，所以它也是一種復雜的社會問題。按照弗洛伊德的觀點，"變態的性行為就是幼兒的性行為"。成年后，當性欲受到現實生活環境的限制或個人人格的缺陷而無法正常宣泄時，即會退回到早年固結點，避開自我控制，直接以幼兒性欲的方式表現出來，形成性變態。所以他認為性變態是在成年人生活中持續地表現幼年性欲的成份并以幼年的方式獲得滿足。

家教是否得當對性變態的形成有著至關重要的影響，父母的言行舉止無不對孩子的幼小心靈留下深深的烙印，所以說父母是孩子的性教育啟蒙教師。父母的性觀念會通過他們的有意或無意的舉動而影響到下一代，例如異裝癥，則是因父母反復安排孩子穿異性服裝培養成的一種嗜好，這是一種條件反射性的性變態形成過程。

同性戀的形成與環境因素有著十分密切的關系。有的同性戀者在孩提時期由于某種遭遇，在潛意識中種下"異性恐怖"的種子，成年后形成一種心理變態，不愿與異性交往。有的同性戀者由于在與異性交往中受挫，感情上對異性產生厭惡之情，同時又受到同性的誘惑而走上歧途，此外，父母撫養不當也是主要的原因。母親過度溺愛兒子，把兒子撫養成毫無男子氣概的弱者。還有些父母因某種原因把男孩當作女孩撫養，把兒子打扮得花枝招展。日久天長，使兒子形成女性心理，成年后往往對同性發生好感，對異性反倒不感興趣。再有一些缺乏異性的環境，如遠洋航船、修道院和監獄等地方，易發生同性戀。