辣椒中有可以刺激人的部分器官的辣椒素，使人的機體產生各種不同的反應。許多人因知道辣椒可以促進食欲便以此為借口多吃而不加節制，而造成便秘、上火、長痘等各種體現體內失調的癥狀。辣椒雖然可以加速身體許多器官組織的運轉，加快新陳代謝，但是它的“副作用”也有許多，對于某些人來說，吃辣椒更是個禁忌。

心臟不好

辣椒中的辣椒素會使循環血量增加，心跳加快，誘發心動過速。因此心腦血管疾病患者應少吃辣椒，否則會妨礙病情的好轉。

腎不好

辣椒素是通過腎臟排泄的，對腎臟有一定的刺激作用，如果腎不好的人經常吃辣，會加重腎臟負擔。

胃酸過多

辣椒素會引起胃酸分泌增加，胃酸多了可引起膽囊收縮，導致膽道口括約肌痙攣，造成膽汁排出困難，從而誘發膽囊炎、膽絞痛及胰腺炎。

便秘

辣椒素具有刺激性，會加重便秘癥狀。痔瘡患者進食后還可能引起痔靜脈充血和水腫，導致疾病惡化，誘發肛門膿腫。