中藥和西藥一樣，不同藥物的藥性是不同的，所以在服用時間上亦應有別：

一般來說，上午9點和下午3點左右，是機體吸收藥物的“黃金時間”，所以此時服用中藥效果最佳。但是，不同藥性的中藥，應講究不同的服藥時機。一般而言，治療虛證和腸胃病的中藥，應在飯前30~60分鐘服藥;而治療心肺病和其他一般疾病的中藥，則應在飯后15~30分鐘服用為佳，以避免藥物對腸胃產生刺激，減少副作用;助消化的中藥，也應飯后服用;而補益藥和瀉下通便的藥物則宜在飯前空腹服用，其中通便的藥物，如大黃、火麻仁等，宜在清晨和白天服用，避免在睡前和夜間服食;驅蟲藥也應在早上空腹服用;安神藥則應在睡前服用。

另外，傳統的中醫理論認為，一般的中藥湯劑應該“溫服”，即藥湯煎煮后立即濾出，在常溫下晾至30℃~40℃時再喝;丸、散一類的中成藥也應該以溫開水送服;屬于解表、發散風寒的中藥，才應該“熱服”，并且可以服后喝些熱稀飯、熱水，以助藥力;而止吐、解毒、清熱的藥，則應該“冷服”，以免引起刺激。一般遵循“寒者熱之，熱者寒之”的原則即可。