中醫藥治療宜補腎為本，兼益氣活血。常用中藥為鹿角膠、仙茅、仙靈脾、黃芪、生熟地、首烏、當歸、蓯蓉、巴戟、補骨脂、菟絲子、枸杞子、阿膠等。國內治療慢性再障常用雄激素合并中醫補腎法治療。

氣血津液的生成無不根據陰陽的互相排斥，互相斗爭，由于疾病的發生發展的根本原因是陰陽失調，因此在臨床治療再障中，以調整陰陽，補其不足，瀉其有余，恢復陰陽的相對平衡為基本原則，時刻觀察陰陽的變化而貫穿于治療之中，在治療八法中運用六法(下、和、溫、清、消、補)。掌握精、氣、神、血、津液的生成變化，排除后天各種因素，歸納和創立了治療再障貧血病的療法。

(1) 清排期

清理排泄致病毒素使其通過大小便排除體外。此期多采用具有溢陰清熱，涼血止血等功效的藥物治療。藥后有腹痛、腸鳴、排氣、便稀、嘔吐、飲食減少等現象，平均服藥3—4個月，發燒，輸血基本控制。

(2)調治期

由于臟腑受熱毒侵襲后，為滲透性地破壞機體免疫功能，使臟腑之間的生克制化關系失調，產生食物的精微吸收障礙，精、氣、神血的生成受之間生、克、侮的互相轉化，臟與臟，臟與腑，臟腑與髓的互相關系，使其陰陽平衡，功能協調，脈絡暢通。是根治再障的關鍵所在。此期多采用以疏通脈絡，清熱解毒為主的藥物盡早恢復受損臟腑的功能以防止各種出血癥狀的再次產生。

(3) 恢復期

經以上兩個時期的治療。病毒已基本排除，脈絡暢通，陰陽平衡，臟腑之間的生、克、侮轉化正常，功能逐步協調機體的實際功能得以恢復加強，控制了疾病向嚴重方向發展。此時，輸血的病人延長輸血時間或已脫離輸血，病程長的患者皮膚由于焦、粗糙開始轉化為細嫩有光澤，皮膚光澤從鼻尖部開始隨即是上額然后從前臀指尖部開始向肩部，在向下肢腿部，患者自覺有精神、有力氣。此為上、中、下三焦已通，臟腑功能已恢復。此期的治療以平補陰陽，補氣健脾，生血為主，方藥心參苓、白術散和補中益氣湯加減。服藥后患者自咸飲食增加精神好轉，血象明顯上升，但應該注意的是此期病情不穩定，每遇感冒或情緒變化，就易復發。

(4) 生長期

此期以補陽為主，治療效果表明是各種血細胞上升最快的時期，患者不適應癥狀基本消失，面色如同常人紅潤而有光澤、血紅蛋白在100g/L以上骨髓增生變為活躍，此時可帶藥出院治療，如遇感冒出現血像上下波動不穩仍需住院治療調治。