偏頭疼是遺傳的。近百年來，神經病學家認為遺傳因素在偏頭疼的發病機制上占有重要地位。例如gawers寫到：“偏頭疼有明顯的遺傳，超過半數的病例可查到遺傳的影響，常常是患者家族中其他成員(最多是父母)有偏頭疼患者。”

偏頭疼的遺傳方式目前還不能最后確認。從家庭成員的分布上看與隱性遺傳不同，屬于常染色體顯性遺傳有不完全性的外顯率，但也有學者認為是隱性遺傳伴不完全性的外顯率。總之，偏頭疼的遺傳性是肯定的，但其遺傳方式尚無定論。