中醫藥治療宜補腎為本，兼益氣活血。常用中藥為鹿角膠、仙茅、仙靈脾、黃芪、生熟地、首烏、當歸、蓯蓉、巴戟、補骨脂、菟絲子、枸杞子、阿膠等。國內治療慢性再障常用雄激素合并中醫補腎法治療。

氣血津液的生成無不根據陰陽的互相排斥，互相斗爭，由于疾病的發生發展的根本原因是陰陽失調，因此在臨床治療再障中，以調整陰陽，補其不足，瀉其有余，恢復陰陽的相對平衡為基本原則，時刻觀察陰陽的變化而貫穿于治療之中，在治療八法中運用六法(下、和、溫、清、消、補)。掌握精、氣、神、血、津液的生成變化，排除后天各種因素，歸納和創立了治療再障貧血病的療法。

(1) 清排期

清理排泄致病毒素使其通過大小便排除體外。此期多采用具有溢陰清熱，涼血止血等功效的藥物治療。藥后有腹痛、腸鳴、排氣、便稀、嘔吐、飲食減少等現象，平均服藥3—4個月，發燒，輸血基本控制。

(2)調治期

由于臟腑受熱毒侵襲后，為滲透性地破壞機體免疫功能，使臟腑之間的生克制化關系失調，產生食物的精微吸收障礙，精、氣、神血的生成受之間生、克、侮的互相轉化，臟與臟，臟與腑，臟腑與髓的互相關系，使其陰陽平衡，功能協調，脈絡暢通。是根治再障的關鍵所在。此期多采用以疏通脈絡，清熱解毒為主的藥物盡早恢復受損臟腑的功能以防止各種出血癥狀的再次產生。