肛門直腸疾病常見的癥狀主要有便血、便秘、脫垂、疼痛、腫張、分泌物增多、肛周潮濕等，由于病因不同，表現的癥狀和輕重程度亦各不相同。

如便血點滴而下或噴射而出，色鮮紅，無疼痛者，多為內痔；大便與粘液、膿血相混，色酶暗，肛門有下墜感者應考慮有肛管直腸癌的可能；便血色鮮紅，伴肛門疼痛，大便干結難解者，多為肛裂；粘液血便、色暗紅、伴有腹痛、便溏、大便次數增多者，多為慢性結腸炎所致。

便秘既可為多種疾病的一個癥狀，又可引起內痔，肛裂出血等其他肛門直腸病癥。

脫垂可見于肛管直腸脫垂以及二、三期內痔，也可見于低位直腸息肉、肛乳頭纖維瘤等。

肛裂、血柱性外痔、炎性外痔、肛門直腸周圍膿腫、混合痔嵌頓，痔手術后等，可出現明顯的疼痛，肛門直腸周圍膿腫可出現肛門內外的紅、腫、熱、痛；血柱性外痔和炎性外痔等，可出現明顯的肛門腫脹伴疼痛。

肛瘺、肛門直腸周圍膿腫、肛竇炎、肛門濕疹、痔核脫出等病變，常可于肛周見到分泌物，且因分泌物的刺激易進一步引起肛門濕疹、搔癢等。

中醫把所有肛腸疾病都稱為“痔”，如“十人九痔”中的痔就是指發生于肛門直腸部位的所有疾病，這是廣義的“痔”的概念，所以以往把治療肛門直腸疾病的專科稱為“痔科”。